Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf5P56477 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms