Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcanP55066 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcanP55066 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NcanP55066 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NcanP55066 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NcanP55066 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
NcanP55066 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NcanP55066 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcanP55066 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms