Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rad23aP54726 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms