Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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