Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms