Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TgfaP48030 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms