Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NodalP43021 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NodalP43021 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms