Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms