Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ThpoP40226 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms