Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lig1P37913 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms