Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rab20P35295 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rab20P35295 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rab20P35295 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rab20P35295 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rab20P35295 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab20P35295 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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