Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SsbP32067 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SsbP32067 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SsbP32067 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms