Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms