Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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