Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VtnP29788 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VtnP29788 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VtnP29788 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VtnP29788 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VtnP29788 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VtnP29788 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VtnP29788 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VtnP29788 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VtnP29788 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VtnP29788 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VtnP29788 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms