Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprmP28828 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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