Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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