Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms