Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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