Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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