Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms