Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms