Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NelfeP19426 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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NelfeP19426 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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NelfeP19426 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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NelfeP19426 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NelfeP19426 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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NelfeP19426 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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NelfeP19426 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms