Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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