Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18529 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18529 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18529 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18529 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18529 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18529 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18529 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18529 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18529 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18529 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18529 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18529 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18529 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18529 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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