Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Defa-rs1P17533 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Defa-rs1P17533 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Defa-rs1P17533 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Defa-rs1P17533 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Defa-rs1P17533 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Defa-rs1P17533 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Defa-rs1P17533 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Defa-rs1P17533 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Defa-rs1P17533 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Defa-rs1P17533 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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