Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DmdP11531 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms