Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd4P10628 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms