Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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