Protein–RNA interactions for Protein: P04944

Ig kappa chain V-VI region NQ5-78.2.6, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04944 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P04944 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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P04944 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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P04944 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04944 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04944 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04944 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04944 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P04944 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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