Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P01667 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P01667 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P01667 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms