Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01655 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01655 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01655 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01655 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01655 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01655 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P01655 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01655 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01655 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms