Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CcnkO88874 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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CcnkO88874 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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CcnkO88874 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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