Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cops6O88545 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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