Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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