Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BckdkO55028 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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