Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarce1O54941 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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