Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zmat3O54836 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms