Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
DffaO54786 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
DffaO54786 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DffaO54786 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DffaO54786 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms