Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms