Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Clk2O35491 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Clk2O35491 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Clk2O35491 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Clk2O35491 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clk2O35491 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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