Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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