Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Prrt1O35449 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Prrt1O35449 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Prrt1O35449 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Prrt1O35449 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Prrt1O35449 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Prrt1O35449 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Prrt1O35449 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Prrt1O35449 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Prrt1O35449 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Prrt1O35449 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Prrt1O35449 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Prrt1O35449 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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