Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Foxd2O35392 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms