Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnih1O35372 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms