Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms