Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms