Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms