Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms