Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms